主角东皇太一（李正翔 配音）是上古神殿的守护者，当上古神殿遭遇入侵时，临危受命带着“天道无极”逃往奥拉星，遭遇重创之后失去记忆，变为萌态亚比，被奥拉星人“兰丁（张安琪 配音）”收留，取名“太二”.太二（张琦 配音）逐渐适应了奥拉星的生活并认识一些小伙伴，他们发现黑暗势力的阴谋，努力守护奥拉星，过程中，太二也开始恢复记忆，肩负起光复神殿的艰巨使命……

邪恶的欲望天魔烧毁生命之树，世间陷入一片混沌。为拯救苍生，孙悟空决定回到过去，复活生命之树。然而此时的他失去了金箍棒，力量时有时无，形体也虚弱不稳定，偶尔会化成一滩水。无奈之下，他只得找到小时候的自己“小石猴”，以寻找小三千世界之主女魃守护的时间之力。

故事发生在风景秀丽的百花村，在那里，生活着一个名为马良（邵亦琛 饰）的男孩，马良虽然顽皮，却热爱画画，颇有天赋。某日，大将军（孟祥龙 配音）和小皇帝（王晓彤 配音）的到来打破了村庄内宁静的气氛，他们得知在村庄地下埋藏着价值连城的金矿，于是企图赶走全部村民，展开挖掘行动。泼墨仙人（吴文伦 配音）预感到百花村将有大难，于是将神笔赐予马良，让马良利用神笔化虚为实的神奇力量，保卫村民们赖以生存的家园。小皇帝见识到了神笔的威力，想要将它据为己有。大将军设计骗过了单纯善良的马良，并且准备利用神笔，将整个村庄毁灭。

十八年前，极恶势力黑羽会潜入了老邪神西城勇的地盘，盗走了修罗面具，利用修罗面具放出魔神，老邪神为了保护城市决定摧毁面具和魔神，却发现魔神只是个婴儿，老邪神收养了婴儿，婴儿因为吸收了部分面具的力量拥有神力，别成为小邪神。小邪神最后控制了面具的力量成为老邪神的接班人，继续守护城市。

成为斗战胜佛的孙悟空竟被怨灵蛊惑，唐三藏遭遇灭顶之灾！危急关头，孙悟空揪出怨灵源头，却发现她竟是与自己有三百年缘分的天人界女神——“幸运星”！为了找出“幸运星”黑化的原因，拯救唐三藏，孙悟空踏上了一场回到过去之旅，却最终流下了一滴眼泪。大圣之泪，为何而流，为谁而流？

唐三藏师徒取得奇经交予天庭的十六年后，世界却并没有因此变好。如今奇经下落不明，天庭派大军大肆搜寻，以天羽山之战为起点，狼妖白狼不辞万难地寻回当年取经的唐僧师徒，小队集结踏上还经之路……史上最颠覆的西游传奇便在此展开。

本季延续《西行纪》前一季剧情，讲述了唐三藏与师徒四人取得奇经交予天宫的十六年后，为了心中正义，再次集结成“西行小队”，重新踏上“还经”之路的故事。

本片讲述了主人公格苏为了世间正义，一心想要找到猴王斗战胜佛的下落，以推翻混世顽猴六耳猕猴的残暴统治。在寻人的过程中，他逐渐发现斗战胜佛的失踪，与暗菩提想要突破封印，重新掌控三界的阴谋有关，而六耳猕猴也只是被暗菩提利用的一颗棋子。最终在神女女魃的感染和帮助下，格苏突破自我，阻止了封印之门的开启，成为真正的英雄。